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本文在考虑创新应用的边际收益率的情形下，建立了一个统一的分析框架，比较了交叉许可与合资研发两种合作创新组织模式下，企业的创新水平及收益，进而给出了两种合作创新组织模式的相对优劣。结果表明：当创新被用于开发同质产品时，合资方式效率更高；当创新被用于开发非竞争性产品时，应该选择交叉许可模式；而当创新被用于开发差异化产品时，合作创新的组织模式选择还与创新的产出弹性有关。