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雷电引发脉冲电磁场对微电子器件设备造成侵害已成为水产养殖自动化系统损坏的主要原因之一。经对系统的现场实际情况和雷电入侵途径分析，提出了直击雷、雷电感应和雷电波的防护措施。对控制房和DCS柜采用避雷针、独立针的直接雷防护；系统电源分别采用箱式电源避雷器、电源避雷器、模块式电源避雷器作为三级电源保护，减少LEMP雷电电磁脉冲辐射；计算机网络与等电位地网间设置低压避雷器或火花隙，防止信号干扰和避免地电压反击；根据传输速率、工作电平、特性阻抗等，选择通信线路的信号防雷保护器的参数和型号。