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【目的】了解上海市嘉定区2007—2016年手足口病流行情况及病原学特征,为手足口病的进一步防控提供依据。【方法】收集嘉定区2007—2016年手足口病报告病例信息并进行统计分析。【结果】2007—2016年共报告手足口病病例37 520例,平均发病年龄为2. 81岁,5岁及以下儿童占92. 05%;发病率呈隔年波动趋势,最低为2015年的217. 03/10万,最高为2016年的461. 83/10万;发病主要集中在4—7月份,占病例总数的55. 95%;病例多发生在农村和城乡接合部,占94. 98%。共采集咽拭子、肛拭子等样品799人份,EV71阳性检出比例最高,为44. 56%。重症手足口病占总病例数的0. 59%,重症病例的病原以EV71为主,占96. 23%。【结论】嘉定区手足口病发病呈一定的周期性和季节性,非城区儿童为手足口病的高发群体,EV71为手足口病尤其是重症手足口病的主要病原,应采取更有针对性的措施,加强对农村和城乡接合部学龄前儿童手足口病的防控。