目的:建立同时测定不同产地、不同部位小根蒜中尿嘧啶、鸟嘌呤、尿苷、腺嘌呤、鸟苷、胸苷、腺苷和2’-脱氧腺苷8种碱基和核苷含量的HPLC法。方法:运用HPLC法测定38份不同部位小根蒜碱基和核苷的含量,并用聚类分析和主成分分析方法,对14份小根蒜鳞茎的测定结果进行分析。结果:38份不同产地、不同部位小根蒜中8种碱基和核苷类成分含量在线性范围内的线性关系良好（r>0.9995）,检出限为10.78～37.62 ng·mL^-1,定量限为35.81～115.28 ng·mL^-1及平均回收率为97.72%～100.29%,RSD<3%。小根蒜不同部位均可检测到8种碱基和核苷类成分,且不同产地、不同部位小根蒜中8种碱基和核苷类成分的质量分数及组成结构比存在明显的差异,部分非入药、非食用部位碱基和核苷含量高于其鳞茎。采用聚类分析能将不同产地的14份小根蒜鳞茎分为2类,且主成分分析法筛选出重庆市万州区小根蒜鳞茎质量的综合评价最好。结论:该实验方法操作快速、简便,重现性好,可用于不同产地、不同部位小根蒜中8种碱基和核苷类成分的含量测定。同时,测定结果为小根蒜不同部位的高效利用提供理论依据。