【摘 要】
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本研究基于表达谱数据系统分析了阿尔茨海默病中的差异表达基因;进一步的GO和KEGG富集分析研究了差异表达基因参与的生物学功能和生物学过程;最后通过mRNA-miRNA相互作用网络
【基金项目】
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贵州省地方病和少数民族疾病创新人才团队(贵州省教育厅);黔南民族医学高等专科学校校基金;教育部“长江学者和创新团队发展计划资助”(IRT13058);贵州省科技计划(黔科合重大专项字[2014]6008号);贵州省创新计划项目(黔教合协同创新中心[2014]06);贵州省科技创新人才团队(黔科通(2016)161号)共同资助
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本研究基于表达谱数据系统分析了阿尔茨海默病中的差异表达基因;进一步的GO和KEGG富集分析研究了差异表达基因参与的生物学功能和生物学过程;最后通过mRNA-miRNA相互作用网络,挖掘了阿尔茨海默病中的关键基因和调控机理。研究表明,990个基因在阿尔茨海默病中差异表达(p-value≤0.01,|log FC|≥2),其中332个基因(33.5%)上调,658个基因(66.5%)下调。功能富集(GO)表明,差异基因参与了Regulation of macrophage activation、Myelin sheath和structural constituent of cytoskeleton等功能。KEGG通路富集分析表明,差异基因参与了,Synaptic vesicle cycle、PI3K-Akt signaling pathway、Nicotine addiction、Dopaminergic synapse和Retrograde endocannabinoid signaling等重要的生物学通路。最后,mRNA-miRNA相互作用网络鉴定了在阿尔茨海默病中6个关键的基因,包括TP53INP1、MET、MBNL3、CEBPB、GNAS和SMARCA4,其中TP53INP1和MET在前人的研究中有报道与阿尔茨海默病密切相关,MBNL3、CEBPB、GNAS和SMARCA4是新发现的一些基因。这些基因可能参与了阿尔茨海默病的发生和发展,可以作为其调控位点和药物靶点。
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