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自＂2011计划＂启动以来,众多高校按照＂国家急需、世界一流、制度先进、贡献重大＂的总体要求,探索多元、融合、动态、持续的协同创新模式与机制。以高校为主导的协同创新在整个创新领域中扮演着重要角色。协同创新效率的重要保证是收益的合理分配,然而协同创新主体在协同创新收益分配方面的问题并没有得到很好的解决。文章基于联盟博弈论充分考虑协同主体的投入、贡献及承担的风险从理论上研究合理的、协同创新的利益分配机制,构建协同创新水平的修正Shapley值模型,以期促使协同主体积极性的提高和满足国家的科技战略需求。