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目的了解上海市饮用水、水源水和环境水中隐孢子虫和蓝氏贾第鞭毛虫污染情况。方法通过抽滤、淘洗、离心浓缩、磁抗体分离和免疫荧光染色等技术检测饮用水、水源水和环境水。结果采集上海市16个区出厂水(32份)、管网水(38份)和小区直饮水(86份)等水样156份,均未检出隐孢子虫卵囊和蓝氏贾第鞭毛虫包囊;采集5个区自来水厂水源水(15份)、黄浦江原水(25份)、动物饲养场周边河水(15份)、污水处理厂出水(9份)和生活污水(6份)等水样70份,隐孢子虫卵囊检出率分别为1份(6.7%)、2份(8.0%)、7份(46.