利用基因组挖掘技术分析短短芽孢杆菌菌株GZDF3全基因组几丁质酶基因家族

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:axun2010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究目的是利用全基因组挖掘技术分析短短芽胞杆菌GZDF3菌株中的几丁质酶基因家族。首先利用Bio Edit软件本地搜索短短芽孢杆菌GZDF3全基因组数据库中几丁质酶基因家族,然后采用在线分析及相应软件分析预测几丁质酶基因氨基酸组成、理化性质、信号肽、疏水性、二级结构等,并构建系统发育树。结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组中预测共存在6个几丁质酶基因,编码6种不同结构类型的几丁质酶。6种几丁质酶均属于糖苷键水解酶第18家族。其中2种几丁质酶N端有信号肽序列和信号肽酶切位点;有2种几丁质酶为碱性蛋白,4种为酸性蛋白,6种均为亲水性蛋白。本研究揭示了短短芽孢杆菌菌株GZDF3基因组中有结构多样的几丁质酶,分析结果将为后续的基因克隆及功能研究提供参考。
其他文献
某型低速柴油机在主机勘验过程中,曲轴轴颈与轴向减振器壳体发生磨损。为了分析磨损原因,建立曲轴组件的有限元模型,对主机勘验过程曲轴组件的变形情况进行仿真模拟。计算在
目的:分析治疗糖尿病神经病变采取中西医结合治疗的临床效果。方法:将我院内分泌科2014年1月~2015年12月收治的60例糖尿病神经病变患者作为观察对象,按照治疗意愿分组,分为观
目的探索建立一套适合当前麻醉本科教育的实习教学模式。方泼采用以麻醉导师制为核心的强化临床培训方法结合严格的临床考核体系对近3年在附属医院实习的学生进行教学管理,并
基于六组滑坡灾害治理工程,首先简要地阐述了地形地貌、地层岩性、地质构造等工程地质条件,滑体特征、滑床形态、变形破坏特征、滑坡影响因素、变形破坏机制及滑坡岩土体物理
盲蝽(半翅目:盲蝽科)种类众多、分布广泛,是一类重要的农业害虫。当前我国苜蓿盲蝽属中发生和危害较重的有中黑盲蝽Adelphocoris suturalis (Jakovlev)、苜蓿盲蝽Adelphocoris
目的探讨针状小尖刀(简称小尖刀)微创治疗桡骨茎突狭窄性腱鞘炎临床疗效。方法对照研究60例桡骨茎突腱鞘炎患者,分为试验组(小尖刀组)30例和对照组(封闭组)30例,分别采用小尖