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黄曲霉(Aspergillus flavus)是一种广泛分布的腐生真菌,是黄曲霉毒素B(aflatoxin B,AFB)和圆弧偶氮酸(cyclopiazonic acid,CPA)的主要产生菌,也是动植物的条件致病菌。全球的玉米、花生和棉籽均不同程度地遭到黄曲霉及其毒素的污染。黄曲霉菌株间在形态学、遗传学和产毒特性上变异较大,且其居群遗传结构也尚不明确。为了揭示黄曲霉居群遗传结构及其产毒素特性的规律,本研究选取了从我国26省区(包括大小兴安岭)不同环境中分离的黄曲霉88株,结合模式菌株和国际权威菌株9株,基于钙调蛋白基因(Ca M)和β-微管蛋白基因(ben A)进行多基因序列分型(multi-locus sequence typing,MLST),使用MEGA 6.0和Structure 2.3.4软件进行系统发育学分析和居群结构推导,并结合菌株的产毒特性(AFB和CPA)进行比较分析。结果显示本研究的97株黄曲霉可分为3个居群,即黄曲霉居群I、黄曲霉居群II和米曲霉居群,该97株黄曲霉共有17个序列型(sequence type,ST),其中我国的88株菌分布于15个序列型。米曲霉居群均不产AFB,黄曲霉居群Ⅰ和Ⅱ的菌株绝大多数都产AFB和CPA,其产毒特性只具有菌株特异性,与居群和序列型无关。黄曲霉菌株产毒特性与地理分布或农作物类型间存在一定关系。我国东北玉米产区、西北干旱棉花产区和南方花生产区的黄曲霉居群Ⅰ和Ⅱ菌株均产AFB和CPA,我国青海可可西里和四川阿坝地区的黄曲霉仅产CPA而不产AFB,不产AFB的米曲霉居群大部分来自我国气候和地理环境多样的华北地区,该地区也是我国农村传统酿造黄豆酱的地区。