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植入前胚胎差异表达基因的筛选是分离、鉴定发育相关基因的关键，是克隆动物发育分子机理研究的基础，哺乳动物植入前胚胎和克隆胚胎材料的获得十分不易，使得筛选差异表达基因的方法在该领域的应用均受到较大的限制，以DDRT-PCR为基础的单胚mRNA差异表达技术的建立，为克隆植入前胚胎发育相关基因及哺乳动物克隆胚胎发育分子机理研究提供有力的工具，本文将在多年研究基础上对该技术及目前筛选差异表达基因的方法进行综述。