【摘 要】
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目的 阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS1 、NS2基因变异特征及遗传进化关系.方法 在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N 1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆至pMD 18-T载体测序,获得NS1、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析.结果 自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72％
【机 构】
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650223昆明,云南农业大学，云南省动物疫病预防控制中心,云南省动物疫病预防控制中心,云南省动物疫病预防控制中心,云南省动物疫病预防控制中心,650223昆明,云南农业大学，云南省动物疫病预防控制中
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目的 阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS1 、NS2基因变异特征及遗传进化关系.方法 在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5N 1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品对病毒NS基因进行扩增,克隆至pMD 18-T载体测序,获得NS1、NS2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析.结果 自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72％；30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列,存在3个不同进化(亚)分支(Ⅰ-1、Ⅰ-2、Ⅱ)；NS1/NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关系；NS1蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存在替代或突变.结论 云南边境地区H5N1亚型病毒NS1/NS2基因具有遗传差异,2010年以来NS基因进化分支Ⅰ-2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株。
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