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在拉卡托斯科学研究纲领的视域下,董氏奇穴从硬核、保护带和启示法三个方面实现了对传统经穴的突破。在硬核上,董氏奇穴扬弃了传统经穴对腧穴的观念性构建,将腧穴还原为单纯的生理器官;在保护带上,董氏奇穴消解了无形之气,扬弃了传统经穴中与现代医学理念相冲突的理论;在启示法上,董氏奇穴不再着重于气感的反面启示法,而采用了全息通应的正面启示法,鼓励医师不断进行实践探索和经验归纳。相比传统经穴的研究纲领,董氏奇穴的研究是进步的研究纲领,它推动了针灸医学的发展。