【摘 要】
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为深入研究α干扰素在猪体内的调节和功能,本研究以猪为实验动物,通过RT-PCR扩增得到α干扰素基因全长编码区序列,提交GenBank数据库,获得登录号为“JQ839262”.生物信息学分
【机 构】
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云南农业职业技术学院畜牧兽医系,云南农业大学动物科学技术学院,云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心
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为深入研究α干扰素在猪体内的调节和功能,本研究以猪为实验动物,通过RT-PCR扩增得到α干扰素基因全长编码区序列,提交GenBank数据库,获得登录号为“JQ839262”.生物信息学分析显示,该基因编码189个氨基酸,预测蛋白分子量为21.32 ku,等电点为6.37.蛋白质结构分析得出,IFN-α存在1个保守域,无跨膜结构,存在信号肽.疏水性分析显示其N端疏水,C端亲水.亚细胞定位显示,该蛋白分泌到细胞周质的概率为92.2％.系统进化分析表明,猪与牛、山羊的亲缘关系较近.同时通过荧光定量PCR法检测了α干扰素基因mRNA在猪13个组织中的表达量,发现在皮肤、肺、肌肉、心、脾中表达量较高.本研究为进一步研究猪α干扰素基因的表达调控奠定研究基础.
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