利用高通量测序开发的熊本牡蛎微卫星标记评价野生和养殖群体的遗传多样性及通用性

来源 :水产学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：huanle986

【摘要】

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利用高通量测序的方法,从熊本牡蛎基因组中开发了20对具有多态性的微卫星标记,通过微卫星标记位点比较了野生群体和养殖群体的遗传多样性。野生群体中,所有位点共扩增出330个

【作者】

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黄飘逸马海涛喻子牛张跃环高红梅彭建军

【机构】

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重庆师范大学生命科学学院,中国科学院南海海洋研究所

【出处】

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水产学报

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

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熊本牡蛎微卫星标记野生群体养殖群体通用性 Crassostrea sikamea microsatellite markers wild populat

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31702340,31470570),重庆市科委自然科学基金(cstc2014jcyjA80013),重庆市教育委员会自然科学基金,(kj1400534),广东省自然科学基金(2017A030310442)

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利用高通量测序的方法,从熊本牡蛎基因组中开发了20对具有多态性的微卫星标记,通过微卫星标记位点比较了野生群体和养殖群体的遗传多样性。野生群体中,所有位点共扩增出330个等位基因,等位基因数(N_a)范围为6~39,平均等位基因数为16.5000;有效等位基因数(N_e)范围为1.3529~33.3617,平均值9.5172;观测杂合度(H_o)范围为0.2000~1.0000,平均值0.6715;期望杂合度(H_e)范围为0.2656~0.9877,平均值0.8321;ShannonWeiner指数(Ⅰ)

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