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丛枝菌根真菌（arbuscular mycorrhizal fungi，AMF）由于不能纯培养，其分子生物学研究起步较晚。Simon等（1992）首次分析了AMFl8S核糖体基因，得到了第一条DNA序列，Wyss（1993）用RAPD-PCR技术得到AMF的RAPDs，Sanders等（1995）对AMF群落的孢子进行遗传分析，发现其孢子间存在着rDNA序列的多型现象，uoyd-MacGilp等1996研究证实了Glomus mosseae种间及其近缘种之间rRNA的ITS基因序列存在多样性。