基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:delphi_quaker
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
   摘要:采用PCR扩增和序列测定等技术,对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和CO Ⅰ基因片段进行初步研究,得到16S rRNA基因片段的大小在613.0~634.0 bp之间,A、T(U)、G、C的平均含量分別为26.5%、29.7%、24.5%、19.3%;CO Ⅰ基因片段的大小为660 bp,碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2%、40.3%、27.2%、15.3%。16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子。COⅠ系统进化树表明,与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecten farreri),其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica)。16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica。
   关键词:岩扇贝;CO Ⅰ基因;16S rRNA;密码子偏好性;系统进化树分析
   中图分类号: S917.4
其他文献
摘要:为实现日光温室、智能温室无人管理下的智能通风控温,设计1种温度差动式日光温室通风系统。该系统采用闭环智能控制,首先用户根据不同季节、不同作物设定不同的上下限温度值;其次系统采集用户设定值、室内作物生长环境温度和室外环境温度,最后通过3个指标之间的差动运算控制日光温室通风口的大小。调试结果表明,温度差动式日光温室通风系统可以将温度准确地控制在设定值范围,上下浮动误差不超过1 ℃,夜间温度提高2
摘要:以沃柑为试材,果实成熟采收后分别以清水、200 mg/kg 2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D) 250 mg/kg咪鲜胺、1.5%壳寡糖溶液浸泡处理5 s,晾干后冷藏于温度为6 ℃、相对湿度为80%~90%的环境中,研究沃柑贮藏期间品质的变化情况。结果表明,在贮藏的60 d期间,沃柑的可溶性固形物含量有所升高,可滴定酸含量先升高后降低,维生素C含量在0~15 d升高,之后急剧下降至较低水平;
摘要:基于可持续生计分析理论中生计策略和生计后果之间的关系,利用云南边境山区566个样本农户的调查数据,采用比较分析法、计量统计法和贫困测度方法,深入剖析云南边境山区农户生计策略选择过程,以及由此产生的一系列生计后果,通过二者之间的关系,辨析山区农户经济发展的制约因素,并提出可供决策者参考的对策建议。研究结果表明,从云南省边境总体情况来看,非农业人口占比增加、复种指数增大、经济作物种植比例上升等生
摘要:以厨余垃圾鸡蛋壳为原料,将其进行一定预处理后,在不同温度下焙烧并磨成鸡蛋壳细粉。将鸡蛋壳粉与甘氨酸按质量比1 ∶ 2混合后在70 ℃下反应90 min,再于室温下静置24 h后得到针状晶体,然后用红外光谱对产物进行表征,经分析可知,反应产物为甘氨酸螯合钙。用X-4数字显示显微熔点测定仪对800 ℃焙烧的鸡蛋壳有膜样品、无膜样品与甘氨酸螯合后得到的产品进行熔点测定;对未焙烧的有膜样品和无膜样品
摘要:以先玉335和郑单958为试材,通过对比分析研究淀粉粒发育与灌浆过程和籽粒淀粉含量的关系。结果表明,在授粉后30 d内,二者淀粉含量无较大差异,淀粉粒的发育从数量、形状和排布上均有差异;但在40、50 d时,先玉335淀粉粒大小较均匀,排列紧密,淀粉含量高于郑单958,而郑单958淀粉粒则大小不一,排列较疏松;到60 d时,先玉335淀粉含量增幅很小,但郑单958增幅较大;淀粉粒发育动态与灌
摘要:为建立一种快速、特异、鉴别诊断猪伪狂犬病毒野毒感染与疫苗免疫株,参考GenBank上公布的猪伪狂犬病毒gE基因序列设计了1对引物,以猪伪狂犬病毒核酸作为模板,PCR方法将扩增得到的核酸序列克隆到PEGM-18T载体上,将克隆载体转化到DH5α感受态细胞中,测序鉴定阳性重组质粒作为标准品建立猪伪狂犬病毒荧光定量PCR检测方法。结果表明,本研究所建立的猪伪狂犬病毒荧光定量PCR方法检测灵敏度可达
我是一个生长在南方的男生,我今年高一。最近一直有一个问题在困扰着我。我喜欢一个女生很久了,数数也有五年了,一直到现在,我见到她依然心跳加速得快要“超频”了。我会故意在放学的时候拖延时间等待她,然后悄悄地跟在她后面,觉得见到她就无比的幸福。当她给我一个有意无意的笑时,我仿佛得到了全世界。这五年来,我都是默默地在关注她,关心她。以前是在初中和小学,时间都比较松,可是现在步入了高中,紧张的高中生活,让我
摘要:以灯盏花组织培养苗为材料,研究He-Ne激光、半导体激光、CO2激光对灯盏花几组抗性指标的影响。使用3种激光对灯盏花组培苗进行不同时间的辐照处理。结果表明,3种激光中,CO2激光辐照60 s时,过氧化物酶活性是对照组的33倍,过氧化氢酶活性是对照组的48倍,超氧化物歧化酶活性比对照组提高3331 U/g;辐照180 s时,丙二醛含量比对照组降低244 μmol/g,可溶性糖含量急剧下降,为0
摘要:通过盆栽试验研究施用微生物有机肥对由尖孢镰刀菌引起的香蕉枯萎病防治效果以及在重金属镉(Cd)胁迫下对香蕉生长情况和土壤中微生物群落组成的影响。结果表明:(1)与对照组(CK、CK Cd)相比,施用微生物有机肥(BIO、BIO Cd)后可显著增加香蕉幼苗根、叶生物量及其总生物量(P<0.05)。此外,还能显著增加土壤中细菌总数35.1×107 CFU/g,降低真菌总数,使香蕉幼苗病情指数由3.
摘要:为研究1-脱氧野尻霉素(1-deoxynojirimycin,简称DNJ)对家蚕中肠BmSuc1基因表达及其酶活性的影响,以5龄第3天家蚕为试验材料,经口添食不同剂量的生物碱DNJ,采用实时荧光定量PCR方法检测中肠BmSuc1的表达情况,同时测定β-呋喃果糖苷酶的活性。结果表明,添食不同剂量的DNJ均能引起BmSuc1基因在添食6、9 h出现上调表达,但相对表达量有一定差异,添食4 μg/