猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xmg11860
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目的分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异。方法设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT—nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析。结果除3’polyA尾巴外,swGX32全长7240nt,ORF1与ORF2重叠4nt,ORF3包含在ORF2序列中。swGX32全基因序列与HEV1—4型核苷酸序列的同源性分别为
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