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脯氨酸顺式肽键与氨基酸序列关联的统计分析
脯氨酸顺式肽键与氨基酸序列关联的统计分析
来源 :内蒙古大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aaaj199054
【摘 要】
:
通过对蛋白质空间结构样板库SLCTBASE中包含顺式脯氨酸的序列进行统计分析,发现了顺式肽键脯氨酸与其序列周围氨基酸存在较强的关联.根据单个氨基酸与构象的关联信息,构造了含
【作 者】
:
李炜疆
张颖
【机 构】
:
内蒙古大学理论物理与理论生物学研究室
【出 处】
:
内蒙古大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2001年1期
【关键词】
:
顺式肽键
脯氨酸
氨基酸序列
统计关联
cis peptide bond
proline
amino acid sequence
statistical cor
【基金项目】
:
国家自然科学基金
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通过对蛋白质空间结构样板库SLCTBASE中包含顺式脯氨酸的序列进行统计分析,发现了顺式肽键脯氨酸与其序列周围氨基酸存在较强的关联.根据单个氨基酸与构象的关联信息,构造了含脯氨酸序列的顺式构象势函数,利用这个构象势可将顺式脯氨酸信噪比由5.4%提高至30%以上.
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