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经过20余年的实践,我国已基本建立起财政绩效评价的制度与方法体系.综合打分制方法是我国财政绩效评价中普遍采用的方法,该方法以其标准化、透明化、简单易行等特点在快速推广财政绩效评价中发挥了重要的作用.然而,综合打分制方法使得多维绩效混合评价、过于注重过程评价、难以准确反映评价对象绩效实质等问题日益凸显,且在科技领域的应用面临更大的挑战.为此,文章重点分析了财政绩效评价综合打分方法的问题与挑战,基于新时代国家全面预算绩效管理的要求及相关国际实践,提出改革综合打分制方法的思路.