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目的：对目前常用的两种检测隐孢子虫感染方法进行估价。方法：取上海某牧场随机采集的20头奶牛粪便用改良抗酸染色法和巢式PCR（Nested PCR）法检测。结果：两种方法均能检测出粪便中的隐孢子虫卵囊，改良抗酸染色法阳性检测率55％，Nested PCR法阳性检测率70％。结论：两种方法均能从感染隐孢子虫的奶牛粪便中捡出隐孢子虫卵囊，可根据需要选择。