在可持续发展中,资源和环境不仅是经济发展的内生变量,而且是经济发展规模和速度的刚性约束。在过去很长一段时间内,各地政府均把注意力更多地放在经济增长上,过多地强调GDP的增长,而往往忽视资源环境等问题。经济增长带来资源枯竭、环境恶化、不可持续性等问题,愈演愈烈。明晰我国生态效率的现状、空间差异与制约因素成为可持续发展所面临的首要问题。本文基于生态效率相关理论,以我国30个省域为研究对象,以2005~2016年为研究期间,建立基于资源-环境-经济三大子系统的生态效率评价指标体系,探讨不同区域之间生态效率的时空差异及其存在的问题。首先,以经济产出GDP作为输出指标,以资源消耗和环境污染等11项指标作为输入指标,运用数据包络法和超效率等方法对省域层面的生态效率进行分析,得出决策单元绩效的有效性和无效性。当结果出现多个省际区域处在生产前沿时,传统DEA无法对有效单元做出排序和分析,影响了实证分析的准确性。据此,引入超效率DEA模型,进一步对相对有效的省份进行生态效率比较分析。传统的DEA模型,没有剔除外在环境因素以及随机干扰误差的影响,无法客观反映各省份生态效率的实际水平。本文运用三阶段DEA模型对生态效率的时间演变趋势、空间差异、效率差异进行实证研究。同时,突破DEA只能计算区域效率值的局限性,本文结合Malmquist指数对不同省份的生态效率进行对比和分解分析,说明全要素生产率变化的来源。最后,立足生态效率的评价和主要制约因素,提出相应的政策建议。研究结论表明:(1)我国区域生态效率总体偏低,且不平衡,地区差异明显,呈现出由东向西逐渐降低的格局,并且这种差异有扩大趋势。(2)通过对生态效率综合指标的分解,分区域而言,生态效率存在明显的地理集中现象,东部远超于中西部地区。(3)第三产业占地区生产总值的比重和区域受教育程度有利于改善生态效率,而政府的环保投资对生态效率的影响不显著。(4)经三阶段DEA调整后的生态效率值出现了下降,说明传统的DEA在一定程度上高估了我国各省份区域的生态效率水平,调整后东中西部大约呈现“M”形趋势。(5)通过构建Malmquist指数,分析结果表明我国各省份经济发展的全要素生产率都有所改善,这主要得益于科学技术进步和技术效率提升共同的努力,但纯技术效率有所降低,说明我国环境资源约束下的经济发展仍处于技术不先进、管理水平落后的状态,纯技术效率成为资源环境与经济协调发展的主要障碍,提高科学技术和管理水平是未来生态效率提升的主要突破口。