人巨细胞病毒PPUL44蛋白核定位信号结合多肽氨基酸序列分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wnijiushisb
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目的寻找与人巨细胞病毒(HCMV)PPUL44蛋白核定位信号(NLS)具有较强结合能力的多肽,研究这些多肽的氨基酸序列特点。方法采用合成的HCMV PPUL44 NLSA和NLSB分别在一个随机多肽文库中筛选出与NLS具有结合能力的克隆,用四色荧光自动测序的方法测定上述克隆的DNA序列,对这些克隆的多肽氨基酸序列进行同源性比较,并与蛋白质文库中已知蛋白的氨基酸序列进行比较。结果与HCMV PPUL44 NLSA具有结合能力的多肽(bNLSApep)的氨基酸序列与细胞输入蛋白Importin a亚单位的氨基酸具有较高的同源序列,其中bNLSApep48氨基酸序列AVVTPVLTEILK与【mportinα亚单位的Arm7区的第18至29氨基酸序列ANIFPVLTEILQ具有极高的相似性;bNLSBpep39氨基酸序列则与lmportin a亚单位的全部8个Arm区的第10至21氨基酸的同源序列相似。结论 HCMV PPUL44 NLSA可能是lmportin α亚单位针对HCMV PPUL44蛋白的特异性识别位点,与lmportin a亚单位Arm 7区结合;而HCMV PPULA4 NLSB则为lmportin a亚单位的非特异性识别位点。本研究结果提供了lmportin a亚单位的Arm重复区是NLS结构结合区的实验证据。
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