基于全基因组序列的黄单胞菌分泌蛋白质预测及其特征分析

来源 :江苏农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiaohu850412

【摘要】

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黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展

【作者】

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覃悦祝友朋韩长志

【机构】

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西南林业大学生物多样性保护学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【出处】

：

江苏农业学报

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

黄单胞菌全基因组信号肽生物信息学

【基金项目】

：

云南省应用基础研究计划项目(2018FG001-028);国家自然科学基金项目(31960314);西南林业大学大学生创新创业项目(201825)

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黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展了预测及分析研究,明确其分泌蛋白在致病过程中具有非常重要的作用。本研究以已经公布全基因组序列的黄单胞菌X.campestris B100、X.campestris pv.campestris str.8004、X.campestris CN14中的蛋白质序列为基础,结合细菌中分泌蛋白的基本特征,采用在线分析程序(包括Sign

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