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目的:探讨手足口病的实验室检测以及相关辅助诊断方法。方法:收治手足口病患者32例,采用实时荧光PCR方法检测手足口病的病原菌,并与常规RT-PCR方法检测结果进行比较。结果:肠道病毒、肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型为手足口病常见的病原体,两种检测结果比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:实时荧光PCR检测方法与常规RT-PCR方法检测吻合度较高,肠病毒71型可作为早期诊断手足口病的指标之一。