猪瘟病毒基因组非编码区的定性、定量与结构分析

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猪瘟病毒是猪瘟的病原体,弄清其基因组的复制与表达是研究猪瘟病毒致病机理、研制抗病毒药物的核心.基因组的非编码区(UTR)是复制和表达的主要调节区,为了确定复制与表达位点在非编码区的具体位置以及主要特征,对猪瘟病毒石门株以及其他毒株基因组的3’和5’非编码区进行了生物信息学的定性、定量与结构分析,分别得到了 17个毒株的 3’ UTR和 56个毒株的 5’ UTR与调节复制、表达起始有关的位点以及共有的保守序列和结构成分.这些顺式调控元件可能是复制起始识别位点、宿主细胞转录因子的结合位点和核糖体起始蛋白质合成的作用位点.据此,对猪瘟病毒复制与表达的机理进行了探讨,为进一步实验提供了非常明确的方向,同时也为与猪瘟病毒同科的丙型肝炎病毒、其他瘟病毒以及其他正链RNA病毒基因组复制的研究奠定了基础.
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