【摘 要】
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[目的]冬虫夏草Ophiocordyceps sinensis是一种重要的食药用真菌,仅分布在青藏高原及其周边高海拔地区,具有独特的生存环境、生物学特性以及显著扩张的基因组.本研究旨在确定冬虫夏草菌的染色体数量,为该物种的基因组测序、进化、遗传和分子生物学研究奠定基础,也为其他虫草菌染色体计数研究提供参考.[方法]二、三代测序辅以Hi-C组装,结合显微观察研究冬虫夏草的染色体数量.选择已组装获得基因组完成图的冬虫夏草1229菌株,首先利用昆虫细胞培养液培养获得芽生孢子,芽生孢子经秋水仙素和溶壁酶处理,获得
【机 构】
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中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室,北京100101;中国科学院大学,北京100049;中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室,北京100101;中国科学院微生物研究所,北京100101;
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[目的]冬虫夏草Ophiocordyceps sinensis是一种重要的食药用真菌,仅分布在青藏高原及其周边高海拔地区,具有独特的生存环境、生物学特性以及显著扩张的基因组.本研究旨在确定冬虫夏草菌的染色体数量,为该物种的基因组测序、进化、遗传和分子生物学研究奠定基础,也为其他虫草菌染色体计数研究提供参考.[方法]二、三代测序辅以Hi-C组装,结合显微观察研究冬虫夏草的染色体数量.选择已组装获得基因组完成图的冬虫夏草1229菌株,首先利用昆虫细胞培养液培养获得芽生孢子,芽生孢子经秋水仙素和溶壁酶处理,获得细胞有丝分裂中期分散的染色体,DAPI荧光染色后使用激光共聚焦显微镜观察计数,结合基因组组装和显微观察的结果确定冬虫夏草染色体数量.[结果]二、三代测序辅以Hi-C组装,得到6条包含两端端粒的完整染色体,染色体之间显示出较强的端粒互作;显微观察结果也支持冬虫夏草1229菌株的染色体数量为6条.[结论]冬虫夏草菌的基因组包含6条染色体,芽生孢子是观察冬虫夏草菌染色体的理想材料.
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