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以4只瘘管山羊为试验动物,采用4×4拉丁方设计,使用克隆测序、遗传指纹以及细胞显微计数等技术,研究以羽毛粉(A)、玉米蛋白粉(B)、豆粕(C)和鱼粉(D)4种蛋白补充料分别配合的混合日粮对瘤胃细菌和原虫群体结构的影响。结果表明:细菌的R.flavefaciens、R.bromii、R-7、Roseburia faecalis、Uncultured T33H60F48、Uncultured GRANT42及1个尚不能定性的类群在组间存在显著差异(P<0.05);原虫的内毛虫、前毛虫、头毛虫、等毛虫4个类群在处理间差异显著(P<0.05)。综上可见,蛋白质源对瘤胃细菌和原虫类群结构有显著影响。