【摘 要】
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宏基因组指样本中全部生物遗传物质的集合。目前，细菌的宏基因组学研究主要包含群落组成结构、遗传多样性以及重要功能基因谱等内容，相关分析通常基于细菌的属或种水平开展。随着高通量测序技术和生物信息学分析技术的发展，宏基因组研究已初步达到细菌株水平解析度，为推断细菌生态和进化规律等提供了新的工具和科学认识。本研究从遗传多样性、疫情暴发溯源研究以及重要功能基因谱3个方面，对基于宏基因组测序的细菌株水平研究进
【基金项目】
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北京新星项目（No.Z201100006820029）～～；
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宏基因组指样本中全部生物遗传物质的集合。目前，细菌的宏基因组学研究主要包含群落组成结构、遗传多样性以及重要功能基因谱等内容，相关分析通常基于细菌的属或种水平开展。随着高通量测序技术和生物信息学分析技术的发展，宏基因组研究已初步达到细菌株水平解析度，为推断细菌生态和进化规律等提供了新的工具和科学认识。本研究从遗传多样性、疫情暴发溯源研究以及重要功能基因谱3个方面，对基于宏基因组测序的细菌株水平研究进展进行了总结，以期为该技术的发展应用提供参考。
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