酸疮痂链霉菌实时荧光定量PCR检测体系的构建及应用

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马铃薯疮痂病是国内外马铃薯(Solanum tuberosum)产区普遍发生的病害,严重影响马铃薯的产量和质量.本研究以马铃薯疮痂病病原菌—酸疮痂链霉菌(Streptomyces acidiscabies)的毒素基因序列设计特异性引物Aci-3/4,从酸疮痂链霉菌基因组DNA中特异性扩增出大小为192 bp的目的片段.灵敏度检测表明,建立的酸疮痂链霉菌实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测体系的灵敏度是常规PCR的1000倍.对测试样品基因组DNA进行扩增的结果表明,qPCR检测病薯和病土DNA扩增的循环阈值(cycle threshold,Ct)均在25~32,而常规PCR未检测到病土DNA条带.本研究建立的酸疮痂链霉菌实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强、灵敏度高的特点,可以快速、准确地检测马铃薯带菌病薯和土壤中酸疮痂链霉菌含量,可为马铃薯疮痂病早期监测和有效防治提供有效的技术手段.
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