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针对当前污染控制模型未综合考虑各方面因素,导致很难准确的计算出施工污染程度问题,提出水利水电工程施工污染控制模型。在保护生态环境的前提下开展水利水电工程,分析其给生态环境带来的影响与危害。通过动态控制与空间多河段子控制设定水污染控制系统,以便获得全局最优解。根据因子分析法及方差极大法将相同属性实施合理归纳,有效减少变量数量。通过惩罚因子完成水利水电工程施工污染控制模型。实验研究结果表明该控制模型具有准确性、高效性以及普遍适用性。