【摘 要】
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蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分。为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeqTM 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11
【机 构】
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陕西中医药大学药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室;江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所;
【基金项目】
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陕西省高校青年杰出人才支持计划项目;江苏省自然科学基金资助项目(BK20170311);咸阳市中青年科技领军人才项目;陕西中医药大学新进博士科研启动经费(104080001)
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蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分。为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeqTM 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11.04G数据,736 309 74条高质量reads （SRA数据库注册号SRP160030）。Trinity do novo组装产生93.646个unigenes,平均长度1 108 nt。功能注释表明所有unigenes在NR、NT、Swiss-port、PFAM、KOG等数据库得到注释,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类57分支, KEGG分析发现1 107条unigenes参与19个次生代谢标准通路。172条unigenes编码蒽醌类生物合成相关的MVA、MEP、莽草酸及聚酮途径28个关键酶。125条CYP450基因可能参与次生代谢物的修饰,73条与糖基转移酶相关。RT-PCR和测序成功验证7个蒽醌及黄酮类候选全长unigenes。MISA还发现18885个SSRs。该研究首次获得掌叶大黄幼苗转录组基因表达特征及蒽醌类生物合成通路基因,为后续基因功能鉴定、次生代谢途径解析及蒽醌类生物合成与调控分子机制研究提供基础资料。
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