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计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段。非连续分子动力学模拟（DMD）与传统的分子动力学模拟（MD）方法有所不同，基于不连续势能和相关的模拟编程方法，运行速度大大提高。本文讨论了DMD方法的特点，总结了DMD方法的应用，重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法，最后对DMD方法的发展前景进行了展望。