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目的：用蛋白质质谱分析法寻找食管鳞状细胞癌相对特异的生物标志物。方法：用金属亲和表面（IMAC3）芯片和表面增强激光解析／电离飞行时间质谱仪（SELDI-TOF-MS）检测44例食管鳞癌患者、42例正常人血清的蛋白质质谱。应用Bio-marker Pattem软件建立决策树分类模型，经交叉验证得到该分类模型对测试组病变人群的诊断率。结果：用食管鳞癌患者与正常人质荷比为M9479．43的一种蛋白质建立的决策树分类模型，在学习模式下44例食管鳞癌患者中有43例被正确诊断,42例正常人有40例被诊断正常，诊断准