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玉米杂交种SC704多年来一直是新疆玉米生产的主栽品种。为了评估不同地区品种的遗传变异程度，本研究利用SSR标记时来自全疆各玉米主要生产地的SC704及其亲本共46份材料分别进行了检测。结果表明，父本ZPL717中存在一定程度的杂合、变异等现象，而大部分母本ZPL773和杂交种的遗传一致性较好，但存在个别疑似混杂的材料。另外，在SSR扩增位点中，ZPL773与B73有94％一致，而ZPL717与M017之间只有41％是一致的。自然变异的累积和天然异交可能是导致SC704及其亲本遗传变异的主要原因。