从非同源蛋白质的一级序列预测其结构类

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对基于氨基酸组成、自相关函数和自协方差函数提取特征参量的蛋白质结构类预测算法进行分析比较,对氨基酸组成和自相关函数相结合的方法,以及氨基酸组成和自协方差函数相结合的方法的预测算法进行了研究.结果表明:对非同源蛋白质数据库,在氨基酸组成和自相关函数相结合的方法中,采用Miyazawa和Jernigan的疏水值时,训练库的自检验的总精度为95.34%,其Jackknife检验的总精度为81.92%,检验库的他检验的总精度为86.61%.在氨基酸组成和自协方差函数相结合的方法中,采用Wold等的疏水值时,训练库
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