【摘 要】
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新型新冠病毒的爆发，给人类安全健康带来了巨大的威胁。在过去的经验中，发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。在过去十几年中，随着高通量测序技术的迅速发展，病毒宏基因组的理论以及技术已被证明在公共卫生，临床病原学诊断等方面发挥着重要的作用。此前，人们对病毒的认识被限制于病毒感染人体进而引起疾病，但是近些年随着人类基因组和微生物组研究表明，病毒与人体之间
【机 构】
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卫生部医药生物工程技术研究中心,临床医学分子诊断国家地方联合工程实验室,广东省核酸分子诊断工程技术研究中心,广东省临床医学分子诊断工程技术中心,广州达安基因股份有限公司
【基金项目】
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国家重点研发计划项目（2021YFE0200400）； 广东省重点领域研发计划项目（2022B1111020003）； 广州市科技重点研发计划（202206080014）；
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新型新冠病毒的爆发，给人类安全健康带来了巨大的威胁。在过去的经验中，发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。在过去十几年中，随着高通量测序技术的迅速发展，病毒宏基因组的理论以及技术已被证明在公共卫生，临床病原学诊断等方面发挥着重要的作用。此前，人们对病毒的认识被限制于病毒感染人体进而引起疾病，但是近些年随着人类基因组和微生物组研究表明，病毒与人体之间存在更广泛的相互作用，部分病毒对人体无害，甚至是有益的。本文主要针对近些年来对病毒宏基因组的兴起与发展，研究的策略以及在医学上的一些应用前景进行综述，并提出病毒宏基因组的一些未来展望。
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