【摘 要】
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目的阐述青海喜马拉雅旱獭肠道菌群组成和群落结构,分析群落分布和种群遗传特征,探讨肠道菌群与环境因素之间的关系。方法对来自青海省3个地理亚区的5个小区共计45份喜马拉雅旱獭粪便样本进行肠道微生物样品的收集,利用16S rDNA技术进行基因测序及微生物多样性分析,得到样本物种分类信息与相对丰度。基于OTU聚类做DCA分析探求肠道菌群与环境因子的关系,使用PICRUSt软件对肠道菌群的功能进行预测。结果喜马拉雅旱獭的肠道菌群主要分布在6个门,10个属,且环境因素中温度、海拔、经度对其影响较大。功能预测发现遗传信
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.81560521),国家卫生健康委鼠疫防治研究重点实验室(No.2019PT310004)联合资助。
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目的阐述青海喜马拉雅旱獭肠道菌群组成和群落结构,分析群落分布和种群遗传特征,探讨肠道菌群与环境因素之间的关系。方法对来自青海省3个地理亚区的5个小区共计45份喜马拉雅旱獭粪便样本进行肠道微生物样品的收集,利用16S rDNA技术进行基因测序及微生物多样性分析,得到样本物种分类信息与相对丰度。基于OTU聚类做DCA分析探求肠道菌群与环境因子的关系,使用PICRUSt软件对肠道菌群的功能进行预测。结果喜马拉雅旱獭的肠道菌群主要分布在6个门,10个属,且环境因素中温度、海拔、经度对其影响较大。功能预测发现遗传信
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