【摘 要】
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通过对TRANSFAC数据库中转录因子结合位点(TFBS)所包含核苷k联体(k-mer)在人类和小鼠基因组启动子区中分布的比较分析,提出一种在人类全基因组启动子区搜索转录调节k-mer模体(trans
【机 构】
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内蒙古大学物理系,内蒙古工业大学物理系
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目f90403010).
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通过对TRANSFAC数据库中转录因子结合位点(TFBS)所包含核苷k联体(k-mer)在人类和小鼠基因组启动子区中分布的比较分析,提出一种在人类全基因组启动子区搜索转录调节k-mer模体(transcription regulatory k-mer motifs,TRKMs)的非联配快速算法——基于距离的保守k-mer搜索算法(distance-based conservative k-mer searching algorithm,DCKS algorithm).应用该算法,对人7-mer转录调节模体
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