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内皮脂肪酶（EL）是脂代谢调控甘油三酯脂酶家族的新成员，其功能主要为水解富含磷脂的高密度脂蛋白（HDL），对其进行选择性抑制而不影响其同源蛋白脂蛋白脂肪酶（LPL）能够提高血浆中HDLc的浓度水平，有利于预防及治疗动脉粥样硬化疾病。目前分子对接中的打分函数对大分子及大蛋白口袋具有偏向性，使得基于分子对接的虚拟筛选成功率普遍不高。本文中，我们将EL和LPL分别与Specs小分子库进行了分子对接，分析了对接打分与重原子数及接触面积的关系，发现对接打分与重原子数及接触面积之间有极高的相关性，即存在重原子数的叠加