全基因组预测多粘类芽孢杆菌SC2的分泌蛋白

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xinliping
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
摘 要 为了解多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)分泌蛋白的典型特征,本研究通过SignalP、ProtCompB、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP、MEME和BLAST等多种分析程序对多粘类芽孢杆菌SC2菌株的全基因组共5439条蛋白质序列进行生物信息的综合分析。结果表明,共获得146个具有典型信号肽的SPⅠ (signal peptidase Ⅰ)分泌蛋白。信号肽序列中出现频率最高的氨基酸依次是亮氨酸、丙氨酸和丝氨酸。对信号肽的切割位点分析发现与枯草芽孢杆菌等一致,均为A-X-A型。通过MEME对信号肽序列进行分析发现存在一种保守基序。最后用BLAST分析发现,在146个分泌蛋白中,89个具有功能描述的分泌蛋白,主要是细胞生长代谢及生物降解酶类,其余57个皆为功能尚未明确的假定蛋白。本研究获得了多粘类芽孢杆菌SC2菌株分泌蛋白的信息,为进一步研究多粘类芽孢杆菌的蛋白功能奠定了基础。
其他文献
"大健康产业"已成为中国大陆经济发展的新机遇、新方向,通过将"大健康产业"与"乡村振兴"相结合,不仅可以为中国大陆经济发展带来新动能,也可以为台湾在"休闲农业""民宿经济""
科研训练对培养学生的创新意识和实践能力有着非常重要的作用。首先分析经济学专业科研训练的作用,然后提出科研训练与实践教学"三结合"的教学模式,并从配套机制、硬件条件和师
以本科院校汽车专业英语教学的发展现状出发,对课程的教学现状及存在的问题进行了剖析,指出了目前汽车专业英语教学方面存在的问题,提出了一些针对课程体系、师资建设和教学
选取1998—2012年为研究区间,衡量人均GDP差异作为变量,以泰尔指数对新疆区域经济差异程度进行分析。研究显示新疆三大区域经济差异呈现扩大态势,组间差异是主因,而组内差异
中国提出的"一带一路"构想,已经得到了全世界六十多个国家的支持。在经济全球化的格局下,将会给中国和世界带来不可小觑的影响。"一带一路"会推动中国和其他沿线国家的经济增
医学是实践性很强的学科,医学模拟中心是临床技能训练和临床能力培训的场所,对于临床技能实践教学有着重要的作用。本研究主要介绍山东省立医院临床技能培训中心的建设与应用
《微观经济学》课程是高等院校经管类专业的基础课和必修课,具有很强的理论性和应用性,其教学效果直接影响学校对商科人才的培养质量.针对培养应用型人才的民办大学的服务定