目的探究检验科微生物检验质量的影响因素与病原菌耐药性。方法选取检验科微生物检验患者一共100例作为本研究的研究对象,收取时间为2015年2月1日至2016年2月1日,对其检验质量影响因素以及病原菌耐药性实施分析。结果在100份标本检验中,检验正确的有80份,所占比为80.00%,错误的有20份,所占比为20.00%,其中分别为痰培养、尿培养、分泌物培养和血培养等,而痰培养检验正确率显著优于其他检验结果;在本次研究中,金黄色葡萄球菌对β-内酰胺类、红霉素、喹诺酮类耐药率较高,耐药率在49.50%以上;大肠埃希菌与肺炎雷柏菌对喹诺酮类、头孢菌素类耐药率较高,耐药率高达49.50%以上。结论在检验科微生物检验质量中具有较多的影响因素,检验科应严格按照临床规范进行操作,同时病原菌耐药性能为患者临床用药提供指导,同时检验科应重视每位检验工作人员的素养和技能,要求其按照标准进行工作,规范用药,能显著提高患者治疗效果。