【目的】研究新疆北疆耕地土壤有机碳含量变化特征及其影响因素分析。【方法】收集1980年新疆第二次土壤普查和2014年土系调查数据汇总，运用方差分析、相关性分析和回归分析等方法，结合土壤全氮、全磷、pH、气候和农用化肥施肥量等影响因子，对比分析2个时期不同土壤类型有机碳含量变化的总体趋势和垂直变化特征，研究影响这种变化的自然因素和人为驱动因素。【结果】（1）2014年新疆北疆不同耕地土壤类型有机碳平均含量总体上比1980年上升1.61 g/kg,变化率4.73%,其中上升最为显著的是灰漠土和棕钙土，变化率分别为20.27%和15.75%。沼泽土的有机碳含量损失显著（27.74 g/kg）,变化率81.58%。（2）大部分土壤类型有机碳含量呈现随土层深度加深而降低的趋势；不同土壤类型同一土层相比较，2014年黑钙土、栗钙土、草甸土和沼泽土耕地表层（0～20 cm）土壤有机碳含量比1980年有机碳含量的平均值降低，降幅达24.57%、6.76%、18.15%和121.174%。而2014年棕钙土和灰漠土有机碳含量平均值则比1980年平均值增加，增幅为15.95%和16.12%。（3）1980年和2014年土壤有机碳与全氮呈显著正相关，相关系数分别为R~2=0.722 1,R~2=0.116 1,与全磷呈正相关，但与pH呈微弱相关。（4）近40年来新疆北疆土壤有机碳含量呈上升趋势，影响有机碳含量变化的主要因素为土壤类型、气候因子、土壤理化性质、化肥施用量及人类活动。【结论】近40年来新疆北疆耕地土壤有机碳含量总体上升高，不同土壤类型土壤有机碳含量差异较大，土壤有机碳与全氮呈显著相关，受多因素影响。