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在经济全球化程度加深的背景下,创新能力日益成为衡量一个地区经济发展水平和核心竞争力的重要指标。三螺旋创新理论阐述了创新主体相互作用的内在驱动力、不同地区能够持续创新的运行机制,弥补了现有创新理论的不足,对于提升整个社会的科技创新效率具有较强的借鉴意义。文章在阐述三螺旋创新理论的基础上运用DEA方法对北京市科技创新系统效率进行实证分析,认为北京市的科技创新系统效率并不是很理想,还存在一些问题,如创新环境有待提高、科技产业化不足、科技创新中介服务体系结构不合理等,并在此基础上提出相应的对策建议。