【摘 要】
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目的:运用网络药理学及分子对接探讨“马勃-白及”治疗糖尿病足(Diabetic Foot Ulcer,DFU)的作用机制.方法:利用TCMSP数据库筛选马勃、白及的化学成分,通过Stich数据库预测潜在基因靶点;利用Cytoscape 3.8.0软件完成“化合物-靶点”网络的构建;通过OMIM等数据库获取DFU的疾病靶点;将“马勃-白及”与疾病的蛋白互作网络导入Cytoscape软件构建药物靶点-疾病的蛋白互作(Protein Protein Interaction,PPI)网络进行拓扑分析获得核心靶点;
【机 构】
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南京中医药大学第一临床医学院,江苏 南京,210029
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目的:运用网络药理学及分子对接探讨“马勃-白及”治疗糖尿病足(Diabetic Foot Ulcer,DFU)的作用机制.方法:利用TCMSP数据库筛选马勃、白及的化学成分,通过Stich数据库预测潜在基因靶点;利用Cytoscape 3.8.0软件完成“化合物-靶点”网络的构建;通过OMIM等数据库获取DFU的疾病靶点;将“马勃-白及”与疾病的蛋白互作网络导入Cytoscape软件构建药物靶点-疾病的蛋白互作(Protein Protein Interaction,PPI)网络进行拓扑分析获得核心靶点;利用DAVID数据库进行基因功能注解(Gene Ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后将主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:马勃与白及中共有14个活性成分和167个潜在基因靶点,共筛选出1202个疾病靶点.拓扑分析获得12个核心靶点参与DFU的治疗,GO功能和KEGG通路富集分析涉及19个生物学过程、5个细胞组成、7个分子生物学功能以及25条信号通路.分子对接结果得出与NOS2受体结合最为紧密的化合物为4,7-二羟基-1-对羟基苄基-2-甲氧基-9,10-二氢菲和β-谷甾醇,与表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)结合最为紧密的化合物为1-(4-羟基苄基)-4-甲氧基-9,10-二氢菲-2,7-二醇.结论:该研究初步揭示了运用“马勃-白及”可通过多组分、多靶点、多通路发挥治疗糖尿病足部溃疡的作用,为日后临床研究和应用提供参考.
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