目的分析湖南省医疗机构传染病防治监督处罚案例违法事实及结案、处罚程序,探讨监督执法中存在的突出问题,并提出初步对策。方法对2009、2010年2年湖南省医疗机构传染病防治监督处罚案例违法事实及结案、处罚程序进行描述性分析和比较。结果 2009年、2010年湖南省医疗机构传染病防治监督处罚案件分别2 273、2 290起,2年医疗机构违法事实分类虽差异有统计学意义(χ2=470.08,P=0.00),但均以违反《医疗废物管理条例》、《消毒管理办法》和《传染病防治法》的规定为主,三类违法事实占总违法事实的89.0%。2年违法案件结案率差异无统计学意义(χ2=0.0,P=0.97),但2年处罚程序、结案情况差异有统计学意义(χ2=14.57、6.60,P=0.00、0.037),2010年更多地采用简易程序,且不予行政处罚的案件比例较2009年降低。结论目前医疗机构医疗废物处置是薄弱环节,违反《艾滋病防治条例》和《突发公共卫生事件应急条例》的案件骤增。医疗机构传染病防治监督执法行政阻力大,行政处罚力度较低,难以有效遏制违法行为。建议建立机制,形成合力,规范监督内容,开展专项监督执法检查和加大整治力度,加强对执法人员和管理相对人的培训,严厉查处违法行为。