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中日两国对于仲景学说的的研究存在诸多差异,比较的结果是:中国学者注重对原著进行理论溯源、引申和发挥;对仲景病因学的认识非常广泛,认为既非风寒一途,亦非多种热性病因所能尽其意;诊疗注重保持施治与辨证在理论上的前后呼应;在运用仲景方药时,推行"师其法而不泥其方"的做法,极讲究辨证,不善固守一方持服到底.而日本学者不重视理论探讨和学术溯源,只是在因、症、方、治等治疗学方面注重探究;在仲景病因学的认识上,存在"万病一毒"及"气、血、水"学说;诊疗模式体现