BioIndex：一种生物序列相似性查询的高效索引

来源 :计算机应用与软件 | 被引量 : 2次 | 上传用户：everywherecsu

【摘要】

：

有效管理生物数据并提供高效的查询方法是生物信息处理的重要研究内容。BioSeg是一个新的生物序列数据模型。查询优化研究是生物数据库管理系统开发的重要内容之一。研究当前生物数据索引技术,针对BioSeg数据模型的特点和生物序列相似性查询需求设计了一种新的生物序列数据索引BioIndex,并设计相应的查询算法。首先,使用MEME(Multiple EM for Moeif Elicit-ation)算

【作者】

：

邱伯仁熊赟朱扬勇

【机构】

：

复旦大学计算机与信息技术系

【出处】

：

计算机应用与软件

【发表日期】

：

2009年10期

【关键词】

：

索引生物序列生物数据库数据模型查询优化 Index Biological sequence Biological database Data model

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目（60573093）.

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