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为了推进福建省农业结构转型升级，进一步加快农业供给侧结构性改革步伐，利用区位商实证分析了２００１—２０１６年福建省农业产业结构调整的区域性变化。从闽东南、闽西和闽北三大经济区域和九个地级市两个层次分析农林牧渔业变化趋势，得出闽东南大多数市牧业为负向调整；闽西地区林业和牧业均为正向调整，渔业为负向调整；闽北地区林业为负向调整的农业调整方向，最后提出实现多元化农业经营方式、突出产业集聚、坚持品牌引领等对策建议。