【摘 要】
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黄麻(Corchorusspp.)是重要的纤维作物,全球种植面积仅次于棉花.在当前全球变暖和气候异常的趋势下,干旱对于作物减产的负面影响尤其凸显.因此,研究黄麻响应干旱胁迫的分子机
【机 构】
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浙江省萧山棉麻研究所,浙江省农业科学院花卉研究开发中心,杭州, 311202;华中农业大学生命科学技术学院,武汉,430070
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黄麻(Corchorusspp.)是重要的纤维作物,全球种植面积仅次于棉花.在当前全球变暖和气候异常的趋势下,干旱对于作物减产的负面影响尤其凸显.因此,研究黄麻响应干旱胁迫的分子机理对于缓解该矛盾具有重要的作用.本研究采用二代测序技术,对干旱胁迫处理下的黄麻幼苗植株进行转录组测序,通过对原始测序数据进行质量控制,并利用Trinity和Corset等软件进行序列拼接,得到了高质量的测序和拼接结果.随后对拼接得到的基因进行功能注释和相关分析,共得到23 297条非冗余基因,其中包含386条编码分属于46个转录因子家族的基因.对基因序列进行简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)分析,获得了所有非冗余基因以及转录因子对应的SSR信息.相关结果为后续针对黄麻响应千旱胁迫的相关研究提供了候选分子资源.
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