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本文利用中国科学技术信息研究所医学学术期刊数据，将指标分为影响力、时效性、期刊特征三个一级指标，它们之间存在两两相关关系，在此基础上建立结构方程进行模拟，计算出3个一级指标值并采用主观赋权法进行期刊的综合评价，取得了较好的结果。结构方程通过模拟期刊指标之间错综复杂的关系，可以对一些隐含指标进行估计，还可以进行指标的筛选，为科技评价提供了一种新的思路。同时要注意的是，基础数据的完备性和模型建立的科学性对评价结果的影响很大。